Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms