Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Saa4P31532 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Saa4P31532 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms