Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col2a1P28481 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col2a1P28481 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col2a1P28481 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms