Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apex1P28352 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apex1P28352 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms