Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pde6aP27664 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pde6aP27664 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pde6aP27664 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6aP27664 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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