Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U2af2P26369 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms