Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms