Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl13aP19253 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms