Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gata1P17679 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gata1P17679 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms