Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04212 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04212 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P04212 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P04212 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms