Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ccl20O89093 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ccl20O89093 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
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Ccl20O89093 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ccl20O89093 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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