Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DffaO54786 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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