Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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