Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms