Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms