Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol7aB2RT54 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms