Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rrn3B2RS91 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms