Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint5A7XUY5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms