Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms