Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubl3Q9Z2M6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms