Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr4a3Q9QZB6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr4a3Q9QZB6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr4a3Q9QZB6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nr4a3Q9QZB6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms