Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col5a3Q9JLI2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col5a3Q9JLI2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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