Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nectin1Q9JKF6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nectin1Q9JKF6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nectin1Q9JKF6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nectin1Q9JKF6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nectin1Q9JKF6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nectin1Q9JKF6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms