Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc97Q9DBT3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms