Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx5Q9D8U8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms