Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4bQ9D8B3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms