Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn23Q9D7D7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn23Q9D7D7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn23Q9D7D7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn23Q9D7D7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn23Q9D7D7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn23Q9D7D7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Cldn23Q9D7D7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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