Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NkapQ9D0F4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NkapQ9D0F4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NkapQ9D0F4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NkapQ9D0F4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms