Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Use1Q9CQ56 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Use1Q9CQ56 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Use1Q9CQ56 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Use1Q9CQ56 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Use1Q9CQ56 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Use1Q9CQ56 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Use1Q9CQ56 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Use1Q9CQ56 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Use1Q9CQ56 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Use1Q9CQ56 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms