Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dok4Q99KE3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms