Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Derl1Q99J56 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms