Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms