Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M10.4Q85ZW8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms