Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms