Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms