Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms