Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms