Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msi1Q61474 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msi1Q61474 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms