Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf1Q61069 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms