Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3USZ8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3USZ8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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