Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms