Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms