Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms