Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai1Q02085 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms