Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Gabpb1Q00420 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gabpb1Q00420 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gabpb1Q00420 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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