Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Arf1P84078 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Arf1P84078 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Arf1P84078 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Arf1P84078 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Arf1P84078 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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