Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx3P81067 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms