Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp3P63024 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms