Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms