Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dbx1P52950 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms